首先，輔助新材料及藥物分子研發(fā)合成設計系統(tǒng)可以通過生物信息技術和結構信息技術，根據(jù)分子結構來預測分子的性質(zhì)，進而智能地設計新的分子聚集體，從而提高材料性能。例如，一種新型電容材料，需要設計一種新型導電分子結構，作為基礎原料，實現(xiàn)結構調(diào)整，通過計算機模擬來預測較佳結構，較終實現(xiàn)新材料的設計。
其次，該系統(tǒng)同樣可以應用于藥物分子研發(fā)合成中。藥物分子常常經(jīng)不斷優(yōu)化和結構調(diào)整后，會具有更強的活性，能夠?qū)崿F(xiàn)對藥物的性能優(yōu)化和更高效的藥效。設計系統(tǒng)通過生物信息學和計算機模擬技術，可以實現(xiàn)藥物分子結構的智能優(yōu)化設計，有助于提高藥物的效果，從而有效地幫助藥物研發(fā)過程。
另外，輔助新材料及藥物分子研發(fā)合成設計系統(tǒng)還具有很廣泛的應用前景，其可以智能化地設計新型材料，并能更快更有效地實現(xiàn)新藥研發(fā)?，F(xiàn)今，該系統(tǒng)已經(jīng)成為一種寶貴的技術資源，能夠幫助研究者們實現(xiàn)精確的科學研究，進一步推進科學發(fā)展。
